受上海市卫生局委托，第三届上海世界卫生组织合作中心主任会议于2009年11月20日在寄生虫病所召开。寄生虫病所所长汤林华研究员作为本次会议的东道主主持会议。WHO 西太区建设健康社区和人群司韩铁如司长、WHO驻华代表处高级项目官员司徒农博士、卫生部国合司国际处丁宝国副处长、上海市医学会会长刘俊教授致开幕词；上海市卫生局党委黄红副书记到会祝贺；全市21家WHO合作中心的主任及联络员参加了会议。

此次会议的主要内容围绕合作中心的职能以及自动化电子系统展开。世界卫生组织合作中心的Claire DUCHESNE BITTON女士就此为各单位作了专题报告。BITTON女士介绍了合作中心的规则与政策，着重介绍了新的合作中心自动化电子系统，该系统主要用于各合作中心递交年度进展报告和指定/再次指定表。BITTON女士强调了各合作中心应保持与各自的合作中心负责官员的联系，加强沟通交流，确保各合作中心工作的有序进行。各合作中心代表纷纷就新系统的使用积极提问，BITTON女士一一作了详细解答。

下届年会承办单位负责人虹口区城市初级卫生保健合作中心王立义主任邀请与会代表明年在虹口相聚。